| Sumario: | La familia de las Rutáceas son un grupo de plantas importantes en México, destacando aquellas especies pertenecientes al género Citrus, por su consumo elevado. Entre las enfermedades importantes en la citricultura mundial están las ocasionadas por los viroides de los cítricos, siendo los principales agentes causales el viroide exocortis de los cítricos (CEVd) y el viroide cachexia de los cítricos (HSVd), descubiertos en los años de 1972 y 1977 respectivamente. En México hay muy pocos trabajos de investigación publicados sobre viroides de los cítricos, menos aún sobre el viroide del enanismo (CDVd), y ninguno de ellos sobre los viroides IV y V (CVd-IV y CVd-V). En la presente investigación se realizó un estudio de las 5 especies de viroides de los cítricos en huertas representativas dedicadas a la producción de estos cultivos en la región noreste de México. Primeramente se utilizó la técnica de electroforesis secuencial, la cual se conoce desde los años 80’s, y posteriormente la técnica RT-PCR que es la que se utiliza actualmente en México en los programas de certificación de cítricos libres de viroides, pero debido a las inconsistencias en los resultados por la dependencia con las especies de cítricos analizadas y con la época del año de los muestreos, así como la distribución irregular de las moléculas de los viroides dentro de la planta, se utilizó también la secuenciación de ADN y se realizaron comparaciones con secuencias de los aislamientos reportados en el Banco de genes (GenBank) del Centro Nacional de Información Biotecnológica de Estados Unidos. También se implementó la hibridación de ARN con sondas no radioactivas para la detección e identificación de tres viroides (CEVd, HSVd y CDVd,), y se implementó el análisis de RT-PCR tiempo real utilizando sondas TaqManMR y sondas marcadas con Sybr-GreenMR. Por último se hizo una evaluación de la incidencia de los viroides de los cítricos en 7 huertas de campo localizadas en los estados de Nuevo León y Tamaulipas
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