Anotación y validación del genoma de levadura cervecera tipo lager Saccharomyces pastorianus 790.
Las levaduras para la producción de cerveza tipo lager, son de relevancia económica que representan la producción de cerveza lager en México ocupa el total de las ventas, sin embargo, por su uso específico en la industria existe poca información disponible del genoma de estas. Se conoce que el genom...
| Autor principal: | |
|---|---|
| Formato: | Tesis |
| Lenguaje: | Spanish / Castilian |
| Publicado: |
2016
|
| Acceso en línea: | http://eprints.uanl.mx/13682/1/1080238055.pdf |
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| description | Las levaduras para la producción de cerveza tipo lager, son de relevancia económica que representan la producción de cerveza lager en México ocupa el total de las ventas, sin embargo, por su uso específico en la industria existe poca información disponible del genoma de estas. Se conoce que el genoma de este tipo de levadura es un hibrido entre Saccharomyces cerevisiae y Saccharomyces eubayanus pero el contenido de cada uno difiere de cepa a cepa dando como resultados diferentes características en las cervezas. En base a los datos semi ensamblados proporcionados por estudios previos, el genoma de una levadura cervecera tipo lager fue anotado en este estudio con la herramienta computacional Maker. El tamaño de este genoma es de 22.7 Mbp contenidos en 133 scafolds. Se localizaron 7328 genes los cuales fueron sometidos a un alineamiento local y obteniendo los promedios de identidad en cada scaffold encontrando que aproximadamente el 96.8% del genoma fue anotado, 53.93% pertenece al genoma de S. cerevisiae, 42.86% pertenece al genoma de S. eubayanus mientras que el 3.20% no fue anotado. Estos resultados confirman la característica híbrida de la cepa lager, además que, con la ubicación de los genes en cada uno de los scaffolds, se propone un nuevo ensamblaje para la levadura usada en este estudio. |
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| language | Spanish / Castilian |
| publishDate | 2016 |
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